В составе Республиканской стоматологической поликлиники функционируют следующие структурные подразделения:
1. Регистратура;
2. Отделение терапевтической стоматологии;
3. Пародонтологический кабинет;
4. Отделение лечебно-профилактической стоматологии;
5. Отдел гигиенистов стоматологических;
6. Кабинет медицинской стоматологической профилактики;
7. Отделение хирургической стоматологии с имплантологией;
8. Отделение стоматологии детского возраста;
9. Отделение ортопедической стоматологии;
10. Отдел ортодонтии;
11. Зуботехническая лаборатория;
12. Центральное стерилизационное отделение;
13. Отдел рентгенологии;
14. Республиканский организационно-методический отдел.